【再現手順】
1) Word2016で文書を入力、ファイル>名前を付けて保存 として、ファイルの種類を "PDF" に変更し保存します

2) 生成されたデータは、通常引き続きPDFビューワーで開きますが、Adobe Acrobat Reader DCで今回は確認してみました。もちろん一旦保存したものを改めて Acrobat Reader DC で開いても同様です。開いたのち、一部のデータをコピーします

3) メモ帳に貼り付けてみると、ご覧いただくように同じ文章が繰り返し貼りついたた形になります

【回避策】
1) 他社のPDFビューワーを使用する:
すべてのPDFビューワーで発生するものではないため、他のPDFビューワーを利用することで回避できることもあります。
以下は、一度、Microsoft Edge で PDF を開いて、ドラッグしてコピーしたものを、メモ帳に貼り付けたものですが、正常に選択した部分の文字のみで、重複することはありません。


2) 保存の際、"アクセシビリティ用のドキュメント構造タグ"を OFF にして PDF 形式で保存する
・保存の際に、"その他のオプション" をONにすると、保存先を指定するダイアログが表示されますが、そのダイアログの下部にさらに選択が可能なオプション項目が表示されます
・"最適化" のところで、"最小サイズ" を選択し、保存します

・こうすることで、Adobe Acrobat Reader DCで表示させた PDF ファイルでも、コピーして、メモ帳に貼り付けても、重複するようなことはありません


-- "最小化" を選択することで、さらに、"オプション" を開くとある "アクセシビリティ用のドキュメント構造タグ" がオフになります。
仮にここの設定が標準のままでも、オプションを開いて、"アクセシビリティ用のドキュメント構造タグ" のみを OFF にしても同様に問題は発生しませんでした

この症状ですが、Word2013 でも確認しましたが同様でした。
Office Support Team Blog JAPAN のブログの中では、Word2010 も対象にはなっているようです。
(ちなみに、サポート期限が切れていた、WindowsVista + Word2007でも試してみましたが、こちらは問題ありませんでした)
<参照>
・PDF ファイルの表示内容をコピーしてテキスト エディタへ貼り付けると内容が重複する/Office Support Team Blog JAPAN
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