ちなみに、ポータブル版のVer.12.17については、初期状態でSSL3.0はオフになっておりましたので、設定というより、確認方法を....
1) 左上の "Opera" をクリックして、 設定>設定 と移動して、設定ダイアログを表示させます

2) 詳細設定タブ>セキュリティ>セキュリティプロトコル と開きます

3) 今回確認した、Portable版のVer.12.17では、すでにオフになって解除されておりましたが、他のバージョンをご利用で、こちらにチェックが入っている場合には外してOKで閉じます

ただし、Operaでも、Ver.15以降は、Google Chromeのように起動オプションを設定し、ショートカットから設定を変更する必要があるようです。
1) Operaのアイコンを右クリックして、プロパティを表示します
2) リンク先のところに、"-ssl-version-min=tls1" を追加します
一応、オフィシャルブログにもありましたが、現在配布されているOpera Ver.25 Stable版はすでに解除されているようなので、特別何もする必要はないようでした。古いバージョンをご利用の場合には、新しいバージョンにUpdateするのも一つの方法かと思われます。
<参照>
・ビジュアルブックマーク付きコンピュータ用 Opera 25
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