そうした場合には、通常は以下のサイトにあるように出てきたときに無効化すれば表示されなくなります。ただしこれが出ない場合には、アクションセンターの設定変更から、"Windowsバックアップ" のメッセージを通知しないように設定を変更することもできます。
・Windows 7 で "バックアップの設定" を促すメッセージが表示された!?
1) スタート画面で右クリックして、すべてのアプリをクリックして開きます
2) コントロールパネル>システムとセキュリティ>アクションセンターの順で開きます
3) アクションセンターの設定を変更>メッセージのオンまたはオフ とひらいて、メンテナンスメッセージの"Windowsバックアップ"のチェックを外して、オフにします
* もちろん、マウスポインタを画面右上に移動してチャームを表示、設定>コントロールパネル と開いても、また、Windowsキー + w にて検索画面から、アクションセンターを検索して表示させても同様です。アクションセンターの画面をだすにいたるまでは、やり方もいろいろですね...慣れた方法でどうぞ。
以上でメッセージは出てこなくなります。バックアップに限らず、アクションセンターで通知されるメッセージについては、この画面から変更が可能です。